Henri naît au château de Pau en 1553. Son berceau était en écaille de tortue.
Placé par son père à la cour de France en 1561, il rejoint sa mère en Béarn en 1567. En 1568 il l’accompagne à La Rochelle et participe avec le parti protestant à la 3ème guerre de religion, marquée en 1569 par les défaites de Jarnac, où meurt Condé, chef de l’armée protestante, et de Moncontour.