Fondé en 1544 par le réformateur Caspar Hédio sur le site du couvent des guillemites, à proximité de l’église Saint-Guillaume, ce collegium permet à des étudiants nécessiteux de suivre des enseignements théologiques, en bénéficiant d’un logement et d’une bourse. Il dépend de la Fondation Saint-Guillaume, elle-même rattachée au chapitre de Saint-Thomas, unique chapitre protestant de France.
De 1903 à 1906, il est dirigé par Albert Schweitzer. Sa bibliothèque renferme une précieuse collection de livres du XVIe siècle qui est gérée par la Médiathèque protestante de Strasbourg. Depuis 1860, le Stift est établi dans un bel édifice néoclassique construit en 1772 par l’architecte Samuel Werner, qui abrite également la direction de l’Union des Églises protestantes d’Alsace et de Lorraine (UEPAL).
